Zpravodaj MRC-Holland - listopad 2016

Přinášíme vám pravidelné novinky za uplynulý měsíc. Přečtěte si, co je nového ve světě MLPA:

Volně dostupný učební modul

Společnost MRC-Holland spustila elektronický učební modul, který vás naučí vše o fragmentech pro kontrolu kvality: jak fungují, jak je interpretovat a jak zajistit, aby vaše MLPA splňovala požadavky na kvalitu. Více podrobností a přístup do modulu najdete v našem článku.

Nové kity a kity s ukončenou výrobou

• Mezi novými produkty představila MRC-Holland SALSA Stabilizační roztok, s nímž předejdete degradaci vzorků DNA a MLPA sond.
• Mezi produkty s ukončenou výrobou jsou všechny RT-MLPA kity, jejichž označení začíná na R a EK1-RT. A stejně tak je ukončena výroba PCR primerů s označením IRD800 a ROX.

Vzorek DNA zdarma k vybraným kitům

Skvělou novinkou je vzorek DNA (SD), který MRC-Holland zdarma dodává k vybraným kitům. K dispozici jsou tři různé typy SD:

• Referenční DNA: Může být použita k identifikaci vhodných referenčních vzorků DNA pro specifické kity, např. P008 PMS2.
• Binning DNA: Může být použit jako Binning DNA vzorek pro určitý kit pro binning mutací specifických sond. Binning a filtrování je proces přiřazení signálu k identitě sondy na základě délky sondy.
• Umělá DNA s duplikací: Může být použita jako umělý pozitivní kontrolní vzorek DNA pro konkrétní kit/y.

Věděli jste, že?

• MLPA nelze použít u vzorků z celogenomové amplifikace (WGA), protože WGA neamplifikuje každou genomovou sekvence se stejnou účinností? WGA způsobuje kolísání relativní přítomnosti oblastí genomu, což se projeví ve změněných poměrech ve výsledcích MLPA.
• DNA jedné diploidní lidské buňky má váhu 6 pg (1 pikogram = 10-12 g)? Pro MLPA budete potřebovat 50-100 nanogramů DNA - přibližně DNA obsah z 10 000 diploidních buněk.
• Z tohoto důvodu nelze MLPA použít na jednotlivé buňky a tato metoda není vhodná pro preimplantační diagnostiku.

Další zajímavosti najdete v kompletním zpravodaji MRC-Holland za listopad 2016.